BioXfinder是由藥融雲數字科(kē)技精心研發的一款針對生物科(kē)研工(gōng)作(zuò)者的綜合性生物數據檢索及分(fēn)析平台,彙集了核酸、蛋白(bái)、蛋白(bái)結構、代謝通路(lù)和信号通路(lù)信息,同時集成了BLAST、生存分(fēn)析、基因ID轉換等生信分(fēn)析工(gōng)具。用戶可(kě)高效的搜尋到自(zì)己想要的信息,并且在無代碼的情況下完成生信分(fēn)析。現有的闆塊介紹如(rú)下:
核酸庫:收錄4000多萬條核酸數據,覆蓋人(rén)、大(dà)鼠、小鼠三個物種,包含核酸序列、序列描述、序列長度、分(fēn)子類型等信息,長序列支持一鍵下載。
蛋白(bái)庫:收錄50多萬條高質量的、手工(gōng)注釋的非冗餘的蛋白(bái)質信息,包含蛋白(bái)質的基本信息、序列、序列特征、功能、名稱和譜系、亞細胞定位、疾病與變異、翻譯後修飾、表達、相(xiàng)互作(zuò)用等信息。
蛋白(bái)結構庫:收錄19多萬條經過X射線單晶衍射、核磁共振、電子衍射等實驗手段确定的蛋白(bái)質結構數據。包括蛋白(bái)3D結構、基本信息、實驗數據、參考文獻等。
通路(lù)庫:收錄1千多張整合的經典通路(lù),覆蓋人(rén)、大(dà)鼠、小鼠三個物種,包含基因、化合物、酶、多聚糖、藥物和疾病之間的相(xiàng)互作(zuò)用關系等信息。
生信工(gōng)具:快(kuài)速、全面、易用的生信可(kě)視化分(fēn)析工(gōng)具。
a. 基因ID轉換:幫助用戶解決常見(jiàn)研究物種的基因ID在不同數據庫之間的ID轉換,并且提供基因的常見(jiàn)注釋信息,爲用戶研究基因提供方便。
b. 生存分(fēn)析:研究不同分(fēn)組之間患者的生存是否存在差異,并對結果進行可(kě)視化呈現。